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Nombre de cas et proportions ne correspondent pour le variant Delta pour les départements #31

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Skiski opened this issue Jul 7, 2021 · 0 comments

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@Skiski
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Skiski commented Jul 7, 2021

Bonjour,

En allant voir les nouvelles courbes sur la proportion de variant Delta en Ardèche, j'ai remarqué que les proportions ne correspondaient pas au nombre de cas. Il y avait 1 cas de Delta et 2 d'Autres, pour des proportions de 25% et 75%, ce qui est clairement faux.

Le lendemain (le 6 juillet), le nombre de cas était le même mais les pourcentages sont passés à 20/80%.

En allant voir le code, j'ai compris que le problème venait du fait que les infos sur les variants sont présentés à l'aide de cumul sur 7 jours glissant. Dans l'algo, il est également fait une moyenne sur le nombre de cas sur 7 jours glissants. Pour obtenir le nombre de cas par jour, on multiplie le taux de Delta par le nombre moyen de cas. Ce qui pour le 6 juillet donne environ 0,5 cas pour le Delta et 2,06 pour les Autres. Avec ces valeurs, on obtient bien 20/80%. Mais après arrondi du nombre de cas, cela ne colle plus.

D'ailleurs le calcul pour la proportion est inutilement compliqué puisque df_variants_dep.tx_C1.values[-1] est justement la proportion recherchée.

Par contre, peut-être qu'il faudrait calculer les proportions après arrondi du nombre de cas pour que ce soit cohérent. Les valeurs ne correspondront pas totalement à la réalité s'il y a très peu de cas, mais avec plusieurs dizaines de cas par jour, cela ne devrait pas changer grand chose.

Merci en tout cas pour ce superbe outil.

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