marvin cwiczenia wstepne

Dla cząsteczki diclofenacu (SMILES: O=C(O)Cc1ccccc1Nc2c(Cl)cccc2Cl) proszę policzyć/wyznaczyć:

• pKa wszystkich grup których to może dotyczyć; wyświetlić wykres udziału poszczególnych cząsteczek w zależności od pH
• Jaka forma związku będzie dominować w żołądku? Czy przy tym pH związek będzie dobrze wchłaniany?
• logP, logD (w pH żołądka) , PSA (polar surface area 2D)
• rozpuszczalność w wodzie:
  • do jakiej kategorii należy dany związek? (Solubility category)
  • pokazać wykres zależności rozpuszczalności (w mg/ml!) od pH
  • ile wynosi rozpuszczalność (mg/ml!) w pH żołądka?
• Czy istnieją tautomery tej cząsteczki?
• Policzyć moment dipolowy oraz ładunki cząstkowe
• Narysować kilka pochodnych tego związku (różne podstawniki, lekkie zmiany w pierścieniu) i spróbować nałożyć te cząsteczki na siebie (3D alignment)