Skip to content

marvin2017_E

filips edited this page Dec 21, 2017 · 3 revisions

Wstęp :: GRUPA E2

  • Odpowiedzi proszę wklejać do dokumentu Office, który po zakończonej pracy należy zapisać i wysłać na mój adres mailowy: kontakt
  • Na pierwszej stronie proszę podać: imię, nazwisko, grupę oraz strukturę w formacie SMILES, dla której przeprowadzają państwo obliczenia.
  • typowe wartości pH w różnych obszarach przewodu pokarmowego pokazane są na rysunku na dole strony; proszę przyjąć dolne wartości zakresów.

Życzę powodzenia! 👍

Zadania

Dla cząsteczki, której SMILES są podane na liście obecności, proszę policzyć:

Zadanie 1

  1. pKa wszystkich grup których to może dotyczyć (załączyć rysunek); dołączyć odpowiedni wykres udziału poszczególnych form w zależności od pH
  2. Czy związek ma szansę wchłaniać się w jamie ustnej, żołądku, jelitach? Odpowiedź krótko uzasadnić.
  3. Dla wartości pH typowych dla śliny, żołądka, jelita proszę:
    1. Policzyć logP, logD (w tych pH); podać wartości oraz załączyć odpowiednie wizualizacje (dla logP i logD)
    2. Policzyć PSA (polar surface area 2D)
  4. Policzyć rozpuszczalność w wodzie:
    1. pokazać wykres zależności rozpuszczalności (w mg/ml!) od pH
    2. ile wynosi rozpuszczalność (mg/ml!) w pH śliny, żołądka, jelita?

Zadanie 2

  • Podać liczbę HBA i HBD w pH=2 i pH=12. Dołączyć odpowiedni wykres zależności od pH
  • Wyznaczyć możliwe struktury rezonansowe. Dołączyć odpowiedni rysunek.
  • Wkleić zasymulowane widmo 1H NMR i 13C NMR
  • Podać wartość momentu dipolowego. Załączyć odpowiedni rysunek pokazujący ten wektor.

pH

(Za: Review of in vitro digestion models for rapid screening of emulsion-based systems, David Julian McClements and Yan Lia, Food Funct., 2010,1, 32-59)

Clone this wiki locally